異なるドメインの会社レコードをマージできる？

マージできます。 マージするとドメインは統合されず、プライマリードメイン・セカンダリードメインとして保持されます。

異なるドメインの会社レコードをマージした場合、ドメインは統合されず、プライマリードメイン・セカンダリードメインとして登録されます。